Ellis Island Fica na Baía Superior de Nova Iorque — Não no Atlântico Aberto

Ellis Island situa-se na Baía Superior de Nova Iorque, um estuário abrigado ligado ao Oceano Atlântico através dos Narrows e Baía Inferior de Nova Iorque. Embora a baía se abra para o Atlântico, a ilha em si não está "no Oceano Atlântico" no sentido geográfico — está num porto protegido, aproximadamente 1,6 km de Manhattan e 270 metros da Ilha da Liberdade. Esta localização foi escolhida precisamente pelas suas águas calmas e proximidade ao porto de Nova Iorque.